Welcome, Sign In First time visitor? Create a New Account
Your cart is empty

Biomiga Express Endofree Plasmid Maxiprep - PD2568-01

Price:
Live chat below or contact us for latest price.


Description :

Introduction 

Key to the kit is our proprietary DNA binding systems that allow the highly efficient binding of DNA to our ezBindTM matrix while proteins and other impurities are removed by Wash Buffer. Nucleic acids are easily eluted with sterile water or Elution Buffer.

Unlike other kits in the markets, no chaotropic salts are contained in the buffer of our patented plasmid purification kit. The purified DNA is guanidine/anion exchange resin residues free.

The EZgeneTM endofree system uses a specially formulated buffer that extracts the endotoxin from the bacterial lysate. The endotoxin level is less than 0.1 EU (Endotoxin) per µg of plasmid DNA. 

This kit is designed for fast and efficient purification of plasmid DNA from 100 to 200 mL of E. coli culture. The maxi column has a plasmid DNA binding capacity of 1000 µg. 

The purified endofree DNA is ready for high performance of downstream applications such as transfection of robust cells such as transfection of endotoxin-sensitive cell lines, primary cultured cells or microinjection.

 

Important Notes

Plasmid Copy Numbers: The yield of plasmid DNA depends on the origin of the replication and the size of the plasmid. The protocols are optimized for high copy number plasmid purification. For low copy number plasmids, both the culture volume and the buffer volume need to be scaled up 2 times. Please contact our customer service for further information and reference Table 1 for the commonly used plasmids, 

 

Table 1 Commonly used plasmid and expected yield.

Plasmid

Origin

Copy Numbers

Expected Yield

(µg per  50 mL)

pSC101

pSC101

5

pACYC

P15A

10-12

5-10

pSuperCos

pMB1

10-20

10-20

pBR322

pMB1

15-20

10-20

pGEMR

Muted pMB1

300-400

100-150

pBluescriptR

ColE1

300-500

100-200

pUC

Muted pMB1

500-700

150-250

 

Host Strains: The strains used for propagating plasmid have significant influence on yield. Host strains such as Top 10 and DH5a yield high-quality plasmid DNA. endA+ strains such as JM101, JM110, HB101, TG1 and their derivatives, normally have low plasmid yield due to either endogenous endonucleases or high carbohydrates released during lysis. We recommend transform plasmid to an endA- strain if the yield is not satisfactory. For purifying plasmid DNA from endA+ strains (Table 2), we recommend use product PD1712.   

 

Table2 endA strains of E. Coli.

EndA- Strains of E. Coli

DH5α 

DH1

DH21

JM106

JM109

SK2267

SRB

XLO

TOP10

DH10B

JM103

JM107

SK1590

MM294

Stbl2TM

XL1-Blue

BJ5182

DH20

JM105

JM108

SK1592

Select96TM

Stbl4TM

XL10-Gold 

EndA+ Strains of E. Coli

C600

JM110

RR1

ABLE® C

CJ236

KW251

P2392

BL21(DE3)

HB101

TG1 

TB1

ABLE® K

DH12STM

LE392

PR700

BL21(DE3)

pLysS

JM101

JM83

TKB1

HMS174

ES1301

M1061

Q358

BMH 71-18

All NM  strains

All Y strains

 

Optimal Cell Mass (OD600 x mL of Culture): This procedure is designed for isolating plasmid grown in standard LB medium (Luria Bertani) for 12 -16 hours to a density of OD600 2.0 to 3.0. If rich mediums such as TB or 2xYT are used, make sure the cell density doesn't exceed 3.0 (OD600). A high ratio of biomass over lysis buffers result in low DNA yield and purity. The maxi column has an optimal biomass of 500-1000. For example, if the OD600 is 3.0, the optimal culture volume should be 100 to 200 mL. 

 

Culture Volume: Use a flask or tube 4 times bigger in volume than the culture medium to secure optimal condition for bacteria growth. Don't exceed the maximum culture volume suggested in the protocol. Incomplete lysis due to over amount of bacterial culture results in lower yield and less purity.

 

Storage and Stability

Buffer A1 should be stored at 4°C once RNase A is added and Buffer ER should be stored at 4°C. All other materials can be stored at room temperature (22-25°C). The Guaranteed shelf life is 12 months from the date of purchase.

 

Before Starting

Prepare all components and get all necessary materials ready by examining this instruction booklet and become familiar with each step. 

 

Important

  • RNaseA:Itisstableformorethanhalfayearwhenstoredatroomtemperature.SpindowntheRNaseAvialbriefly.AddtheRNaseAsolutiontoBufferA1andmixwellbeforeuse.Storeat4°C.
  • BufferB1precipitatesbelowroomtemperature.Itiscriticaltowarmupthebufferat50°Ctodissolvetheprecipitatesbeforeuse.
  • BufferN3mayformprecipitatesbelow10°C,warmupat37°Ctodissolvetheprecipitatesbeforeuse.
  • KeepthecaptightlyclosedforBufferB1afteruse.
  • Makesuretheavailabilityofcentrifuge(13,000rpm).Especially,aftermixingthelysatewithethanol,thesampleneedstobeprocessedimmediatelybycentrifugation.
  • Carryoutallcentrifugationsatroomtemperature.

 

Materials supplied by users

  • 100%ethanol
  • Highspeedcentrifuge
  • 50mLhighspeedcentrifugetubes
  • 50mLconicaltubes
  • IsopropanolifprecipitatetheplasmidDNA.

 

Kit Contents

Catalog #

PD2568-00

PD2568-01

PD2568-02

Preps

2

10

25

ezBindTM Columns

2

10

25

Filter Syringe (60mL)

2

10

25

2.0 ml Microfuge tube

4

20

50

Plastic wrench

1

1

1

Buffer A1

22 mL

110 mL

270 mL

Buffer ER

 1.2 mL

5.5 mL

14  mL

Buffer B1

22 mL

110 mL

270 mL

Buffer D1

2.5 mL 

11 mL

28 mL

Buffer N3

8 mL

40 mL

80 mL

Buffer RET 40 mL 200 mL 2×250 mL

40 mL

2×100 mL

5×100 mL

DNA Washing Buffer*

15 mL

54 mL

2×54mL

RNase A (20 mg/mL)

2.2 mg

(110 µL)

11 mg

(550 µL)

27 mg

(1.35 mL)

Endofree Elution Buffer

 12 mL

60 mL

135mL

User Manual

1

1

1

*Add 60 mL (PD2568-00) or 216 mL (PD2568-01) or 216 mL (PD2568-02) 96-100% ethanol to each DNA Wash Buffer bottle before use.  


  • Model: PD2568-01
  • Manufactured by: Biomiga

Additional Images